Gli azionisti di Helsana SA sono le due fondazioni Fondation Sana e Artisana. Fondation Sana detiene una quota del 79 per cento del capitale azionario di 70 milioni di franchi. Il Consiglio di fondazione consta di 21 membri e di un comitato di sette membri. La fondazione Artisana detiene una quota del 21 per cento del capitale azionario ed è diretta da un Comitato di fondazione composto da cinque membri.
Helsana non detiene partecipazioni in società quotate in borsa appartenenti al suo perimetro di consolidamento né partecipazioni incrociate in cui una parte detiene più del cinque per cento del capitale o dei diritti di voto. A decorrere dal 1° ottobre 2022, Helsana ha rilevato al 100 per cento le azioni di Aviga AG, una società di partecipazione condivisa del gruppo Helsana e del gruppo Swiss Life. Un ulteriore passaggio prevede l’integrazione di Aviga AG in Health & Medical Service AG (HMS AG), detenuta al 100 per cento da Helsana. La conclusione della fusione di Aviga AG e HMS AG è prevista nel corso del 2023.